Подозреваю банальную проблему регистра символов. Скажем, файл (в utf-8) на файловой системе называется "InfEcted.exe", а виндовская программа, привыкшая к тому, что ОС регистр не различает, приводит к верхнему регистру и обращается к "INFECTED.EXE", а драйвер ФС не находит такой файл (сама NTFS поддерживает различение регистра символов).

в принципе проблема не актуальна тк все решилось средствами из под винды